结构是系统内部诸要素之间相互联系的组织形式。任何系统都有其结构，结构是系统的一种普遍属性。不同系统有不同的结构，每一系统都有其特定的结构。系统的结构是系统的整体与其要素之间相互联系的桥梁，系统与要素、要素与要素之间通过结构相互作用着。

系统的结构的性质和形态有多种多样。从结构的内容来看，有物质结构（如分子结构、原子结构）、意识结构（如思维逻辑结构、语法结构）；从结构的形式来看，有空间结构、时间结构、时空结构、功能结构；从结构的发生和保持来看，有自然结构（如太阳系结构、地质结构）、人工结构（如楼房结构、机器结构），有内容和形式不发生变化的静态（死）结构（如晶体结构）、内容和形式发生着变化的动态（活）结构（如耗散结构），等等。

一个现实系统往往可以同时具备多种结构。例如人，既有物质结构，又有意识结构；既有空间结构，又有时间结构、时空结构和功能结构等。这些结构不但在内容和形式上，而且在属性和功能上存在巨大差别。

研究系统的结构特别是人的结构对于医学有重大意义，弄清结构可以了解机体内部的组织状态、组织特性和组织机制，为诊治疾病提供依据；认识并区分不同结构的不同性质对于医学的现代发展具有重大意义，如经络研究已显示出，经络结构与已知的解剖形态结构不吻，可能属于功能结构或其他更复杂的结构。